Guía 2026

Facturación electrónica en el transporte de carga: los programas.

En el transporte de carga se emiten dos facturas distintas, y cada una sale de un tipo de programa diferente. La empresa de transporte habilitada le factura el flete al dueño de la carga con una factura especial, que lleva las remesas del RNDC y se carga allá. El dueño del camión le factura a la empresa el valor a pagar con la factura de venta de cualquier negocio, y con el mismo programa emite el documento soporte de lo que les compra a quienes no facturan. Esta guía explica qué lleva cada factura y qué programas la emiten, según lo que cada uno publica, con su precio.

Por Juan Diego Gómez · Creador de Flete. Actualizada el .

Flete es uno de los programas de esta guía. Por eso cada dato de los demás sale de su sitio oficial, consultado el 14 de octubre de 2026, y la guía dice también lo que Flete no hace.

La respuesta corta

Si usted…La factura que emiteQué programa la emite
Es una empresa habilitada y le factura el flete al dueño de la cargaLa factura de transporte, con el tipo de operación 12 y las remesas del RNDC en sus renglones. Después se carga en el RNDCUn ERP de transporte, como Sotcarga o Transportando, o un facturador que maneje el tipo 12, como Siigo
Tiene uno o varios camiones y le cobra el valor a pagar a la empresa de transporteLa factura de venta de siempre. Registrarla en el RNDC es opcionalEl servicio gratuito de la DIAN, un facturador como Siigo o Alegra, o un programa para transportadores que también factura, como Flete o Quadre
Le compra a alguien que no factura, como un taller pequeño o un lavaderoEl documento soporte, que emite usted mismoLos mismos del renglón anterior. En Flete sale del gasto que registró el conductor

Por qué hay dos grupos de programas

Las empresas que expiden manifiestos son pocas, y los dueños de camión son muchos. En 2025 se expidieron más de 13 millones de manifiestos, y los expidieron 2.620 empresas, según el balance del RNDC que publicó el Ministerio de Transporte el 12 de febrero de 2026. En cambio, en el país hay 318.468 propietarios de vehículos de carga, y el 80,3 % tiene un solo vehículo, según datos de Colfecar que publicó La República el 30 de septiembre de 2024.

La factura con remesas es solo de esas empresas. El dueño de camión que factura emite la misma factura de venta que emite cualquier negocio, y para esa hay muchos programas. Al cierre de 2024 había 1.324.817 facturadores electrónicos habilitados, según el informe de gestión de la DIAN, y el 31 de agosto de 2026 la DIAN tenía 97 proveedores tecnológicos habilitados.

La factura de transporte, la que va al RNDC

La DIAN define varios tipos de operación para la factura electrónica de venta, y el 12 es el de transporte (numeral 13.1.5.1 de su anexo técnico). Es la factura que la empresa de transporte habilitada le expide al generador de la carga, y según la guía del Ministerio de Transporte para cargarla en el RNDC, en su versión 11 del 16 de marzo de 2024, tiene tres cosas que no tiene una factura común.

  • Cada renglón dice qué es. Una remesa radicada en el RNDC, u otro servicio, como una escolta o un montacargas. En el archivo de la factura esa marca es un 1 o un 0.
  • Cada remesa va con sus datos. El renglón lleva el radicado de la remesa en el RNDC, su número, el valor del flete en pesos enteros y la cantidad transportada, en kilogramos o en galones.
  • Después se carga en el RNDC. Cuando la DIAN la valida, la empresa entra al RNDC con un usuario especial, el Usuario Facturación Electrónica, y en el menú Cumplir, opción Factura Electrónica, carga el XML que devolvió la DIAN, uno solo o varios en un archivo .zip. También lo puede enviar por webservice.

El generador de la carga revisa la factura en el RNDC y la aprueba, y con eso quedan en firme los fletes de sus remesas. Los plazos para facturar y para aceptar, y el control del 20 % que frena a la empresa atrasada, están en factura electrónica en el transporte de carga, quién le factura a quién.

Para emitirla no hace falta un ERP. La empresa puede expedir el manifiesto en el portal del RNDC, que es uno de los tres caminos que da el artículo 6 de la Resolución 20263040016075 de 2026, facturar con un programa que maneje el tipo de operación 12 y cargar después el XML en el RNDC. Lo que ahorra un ERP es digitar dos veces.

Los programas de las empresas habilitadas

Lo que sigue es lo que cada programa dice de sí mismo en su sitio, consultado el 14 de octubre de 2026. No es una prueba de cada producto.

  • Sotcarga (Sísifo). Un ERP para empresas de transporte de carga, de Bogotá. Su sitio dice que envía las facturas electrónicas a la DIAN, que después manda al RNDC el XML que genera la DIAN y que cumple ante el RNDC de forma automática a las 72 horas. También hace las remesas, los manifiestos y los cumplidos. Precio por cotización, con demostración gratuita.
  • Transportando. Un ERP en la nube para empresas transportadoras, que dice cumplir los requisitos del Ministerio de Transporte, el RNDC y la DIAN. Crea los manifiestos desde las remesas y factura a través de Facture, un proveedor tecnológico. Desde $79.900 por usuario al mes.
  • SITca. Un software web para empresas de transporte terrestre de carga. Su sitio menciona la transmisión al RNDC y las remesas, y su blog explica cómo se carga la factura electrónica en el RNDC. No publica precio.
  • Odoo, con el módulo RNDC de MI ERP APP. Un módulo para Odoo 19 que registra en el RNDC las remesas, los manifiestos y sus cumplidos, y carga el XML de la factura electrónica de transporte. Se vende en la tienda de aplicaciones de Odoo, con una licencia de pago único de USD 8.000 que incluye la instalación guiada y 60 días de soporte.
  • Siigo. Un programa de facturación y contabilidad para cualquier negocio, que no expide manifiestos. Según su portal de clientes, su factura electrónica tiene un formato para el sector transporte, en el que cada renglón lleva el radicado de aceptación de la remesa, su número, el valor del flete, la cantidad, la unidad de medida y si es una remesa del RNDC o un servicio adicional.

Avansat, Silogtran y GELOTRA aparecen en directorios de software, pero no encontramos un sitio oficial que diga qué hacen, y por eso no están. Los demás tipos de software de una empresa de transporte, como el monitoreo de flota, están en la guía para elegir un software de transporte de carga.

Los programas de los demás transportadores

Para la factura de venta, el documento soporte y las notas crédito, débito y de ajuste sirve cualquier programa de facturación electrónica habilitado. Son de tres clases.

El servicio gratuito de la DIAN

La DIAN tiene un servicio de facturación gratuito, sin límite de documentos, y quien lo usa puede pedir sin costo el certificado de firma digital, que dura dos años. Emite la factura de venta, las notas crédito y débito, y la factura AIU, de mandato y de exportación, y genera los eventos de las facturas que usted recibe. También emite el documento soporte y su nota de ajuste, según su instructivo de septiembre de 2022. Lo que no tiene es la información de sus viajes, así que el manifiesto y el valor de cada uno se escriben en la factura.

Los facturadores generales

Son programas de facturación para cualquier negocio, que en otros planes tienen también contabilidad, inventario, punto de venta y nómina. Siigo y Alegra publican sus precios.

  • Siigo. Vende la facturación por documentos al año, con pago anual. Tiene un plan gratis con 5 documentos al año, uno de 24 documentos por $119.900 y uno de 120 por $269.910 el primer año, que de lista vale $299.900. Sus planes de facturación incluyen el documento soporte y los eventos de las facturas recibidas, y su factura tiene el formato del sector transporte. Siigo dice ser «el proveedor número 1 de facturación electrónica en Colombia».
  • Alegra. Cobra la facturación al mes, según los ingresos de la empresa, con facturas de venta ilimitadas. El plan más barato cuesta $17.900 al mes, o $161.100 pagando el año, para ingresos de hasta $10 millones al mes, y el siguiente $49.900, para ingresos de hasta $40 millones. El certificado de firma digital va incluido, y tiene un buzón que recibe las facturas de los proveedores y genera sus eventos. El documento soporte aparece en su ayuda dentro de Alegra Contabilidad, que cuesta desde $74.900 al mes. Alegra dice que «más de 40.000 pymes en Colombia» usan su sistema de facturación.

Los programas para transportadores que también facturan

Llevan las cuentas de los viajes y emiten la factura desde ellos.

  • Flete. La factura de venta sale de los viajes que usted elija, con el cliente y el manifiesto que ya estaban registrados, y también factura lo que no es un viaje. El documento soporte sale del gasto que registró el conductor. Emite las notas crédito, débito y de ajuste, recibe las facturas de los proveedores en un correo propio de cada empresa y registra sus eventos. Los documentos llegan a la DIAN a través de Factus. Se paga por paquetes de documentos para usar en un año, desde 150 por $200.000, y quien solo factura no paga mensualidad.
  • Quadre. Lleva los viajes, los gastos y la nómina de los conductores, y la facturación electrónica va incluida en su precio, de $39.900 a $29.900 por camión al mes según el tamaño de la flota. Si el viaje tiene sus remesas registradas, su factura sale como factura de transporte de carga. Según su propio sitio, no reporta al RNDC. Cómo se compara con Flete, con la facturación y todo lo demás, está en Flete vs Quadre.

Hay muchos más. La DIAN tiene 97 proveedores tecnológicos habilitados, y varios venden facturación electrónica a negocios pequeños. La comparación de la facturación de Flete con la de Siigo y Alegra, tema por tema, está en Flete vs Siigo vs Alegra.

Los programas, de un vistazo

Según el sitio oficial de cada uno, consultado el 14 de octubre de 2026. «No publicado» quiere decir que no lo encontramos escrito, no que el programa no lo haga.

ProgramaPara quiénFactura de transporteDocumento soportePrecio publicado
Sotcarga (Sísifo)Empresas habilitadasSí, y envía al RNDC el XML de la DIANNo publicadoPor cotización
TransportandoEmpresas habilitadasDice cumplir con el RNDC y la DIAN, y factura a través de FactureNo publicadoDesde $79.900 por usuario al mes
SITcaEmpresas habilitadasNo publicadoNo publicadoNo publicado
Odoo con el módulo RNDC de MI ERP APPEmpresas habilitadasCarga en el RNDC el XML de la DIANNo publicadoLicencia de USD 8.000, de pago único
Servicio gratuito de la DIANLos demásNo publicadoSí, con su nota de ajusteGratis, sin límite de documentos
SiigoLos demásSí, con el formato del sector transporteSí, en sus planes de facturaciónGratis hasta 5 documentos al año, y 24 por $119.900 al año
AlegraLos demásNo publicadoSí, en Alegra ContabilidadDesde $17.900 al mes, con ingresos de hasta $10 millones al mes
QuadreLos demásCon el formato de transporte, una línea por remesa con su radicado. No la registra en el RNDCSí, incluidoDe $29.900 a $39.900 por camión al mes, con la facturación incluida
FleteLos demásNoSí, desde el gasto del conductorPaquetes desde 150 documentos por $200.000 al año, sin mensualidad si solo factura

Seis preguntas para elegir

1. ¿Usted expide los manifiestos?

Si es una empresa habilitada, necesita la factura de transporte con las remesas y cargarla en el RNDC, y le sirve un ERP de transporte o un facturador que maneje el tipo de operación 12. Si trabaja con empresas que expiden los manifiestos, su factura es la de venta de siempre, y un módulo de RNDC no le sirve.

2. ¿Cuántos documentos emite al año?

Cuente las facturas, los documentos soporte y las notas. Con pocos, el servicio gratuito de la DIAN o un plan pequeño alcanzan. Siigo y Flete cobran por la cantidad de documentos, así que sabiendo cuántos emite sabe cuánto va a pagar.

3. ¿Cuánto factura al mes?

Alegra no cobra por documentos sino por ingresos, y su plan más barato es para quien factura hasta $10 millones al mes. Un camión que trabaja todo el mes puede pasar de esa cifra, y entonces le corresponde el plan siguiente.

4. ¿Factura con IVA?

El transporte nacional de carga está excluido de IVA, pero si además vende algo gravado, necesita un programa que maneje el IVA. Flete solo emite facturas de servicios excluidos de IVA, como el flete.

5. ¿Quiere que la factura salga de sus viajes?

Un facturador general no conoce sus viajes, así que el manifiesto, la placa y el valor se escriben en cada factura. Un programa para transportadores saca la factura de lo que ya registró y le muestra lo que le falta por facturar.

6. ¿Le llegan facturas de sus proveedores?

Si tanquea, compra llantas o paga peajes con factura electrónica, le llegan facturas al correo. Mire si el programa las recibe solo y si le deja registrar los eventos que pide la DIAN, como el acuse de recibo y la aceptación.

Qué hace Flete y qué no

Lo que sí hace

  • La factura electrónica de venta sale de los viajes que usted elija, con el cliente y el manifiesto que ya estaban registrados, y Flete le muestra los viajes que le faltan por facturar. También factura lo que no es un viaje.
  • El documento soporte sale del gasto que registró el conductor, con su valor y su descripción, y Flete trae de la DIAN el nombre del proveedor.
  • Las notas crédito, débito y de ajuste corrigen o anulan un documento sin salir de Flete.
  • Las facturas de sus proveedores llegan a un correo propio de cada empresa, quedan guardadas con su XML y su PDF, y desde ahí se registran sus eventos ante la DIAN (cómo se hace).
  • Una empresa que solo quiere facturar deja Flete en modo de solo facturación, y paga solo el paquete de documentos.

Lo que no hace

  • La factura de transporte. No emite la factura con el tipo de operación 12 que se carga en el RNDC, ni reporta los manifiestos.
  • Facturas con IVA. Factura servicios excluidos de IVA, como el flete.
  • Nómina, punto de venta y contabilidad general. No emite la nómina electrónica ni tiene punto de venta. Lleva las cuentas de los viajes y le entrega al contador los reportes en Excel, entre ellos el de documentos DIAN.

Si lo que necesita está en esta segunda lista, otro programa de esta guía le sirve más. Todo lo que hace Flete está en las funciones de Flete.

Preguntas frecuentes

¿Qué es la factura electrónica de transporte de carga?

Es la factura electrónica de venta con el tipo de operación 12, Transporte, que define la DIAN en su anexo técnico. La expide la empresa de transporte habilitada al generador de la carga, lleva en cada renglón la remesa del RNDC con su radicado, su número y el valor del flete, y después se carga en el RNDC.

¿El dueño del camión tiene que expedir la factura de transporte?

No. Esa factura es de la empresa habilitada que expide el manifiesto. El dueño que le cobra el valor a pagar a la empresa, si está obligado a facturar, emite la factura de venta de siempre, y registrarla en el RNDC es opcional según el artículo 13 de la Resolución 20263040016075 de 2026.

¿Qué programa emite la factura que se registra en el RNDC?

Un ERP de transporte, como Sotcarga, Transportando u Odoo con un módulo de RNDC, o un facturador que maneje el tipo de operación 12, como Siigo, que tiene un formato para el sector transporte. El XML que devuelve la DIAN se carga en el RNDC desde su portal o por webservice.

¿Se puede facturar electrónicamente gratis?

Sí. La DIAN tiene un servicio gratuito, sin límite de documentos y con el certificado de firma digital sin costo, que emite facturas, notas y documentos soporte. Siigo tiene además un plan gratis con 5 documentos al año.

¿Cuánto cuesta un programa de facturación electrónica?

Siigo vende planes por documentos al año, desde 24 por $119.900. Alegra cobra según los ingresos, desde $17.900 al mes para ingresos de hasta $10 millones al mes. Flete vende paquetes desde 150 documentos por $200.000 para usar en un año, sin mensualidad si solo factura. Quadre incluye la facturación en su precio por camión, de $29.900 a $39.900 al mes.

¿Flete emite la factura que se registra en el RNDC?

No. Flete emite la factura electrónica de venta, el documento soporte y las notas crédito, débito y de ajuste, a través de Factus. La factura de transporte con el tipo de operación 12 todavía no la emite.

Cómo se hizo esta guía

Los datos de cada programa salen de su sitio oficial, su portal de ayuda o su ficha en una tienda de aplicaciones, consultados el 14 de octubre de 2026. Los de Quadre son los mismos de la comparativa, revisados ese día. Lo que lleva la factura de transporte sale de la guía del Ministerio de Transporte para cargarla en el RNDC, y las cifras, de la DIAN y del Ministerio.

Los precios cambian. Si un dato está desactualizado, escríbanos a soporte@flete.com.co y lo corregimos. Esta guía es informativa.

Fuentes

Normas y guías oficiales. Guía Factura Electrónica de Transporte, versión 11, Ministerio de Transporte, Resolución 20263040016075 de 2026 del Ministerio de Transporte (RNDC), Resolución Única 000227 de 2025 de la DIAN, Facturación gratuita DIAN, Nuevas funcionalidades del servicio gratuito de la DIAN, Instructivo del documento soporte en el servicio gratuito de la DIAN.

Cifras. Ministerio de Transporte, 12 de febrero de 2026, La República, 30 de septiembre de 2024, con datos de Colfecar, Informe de Gestión DIAN 2024, Consolidado Cifras SFE de la DIAN.

Programas de las empresas habilitadas. sotcarga.com, transportando.com.co, sitcaglobal.com, el módulo RNDC en la tienda de Odoo, la factura para empresas de transporte de carga en el portal de Siigo.

Facturadores y programas para transportadores. siigo.com/precios-siigo, siigo.com/facturacion-electronica, alegra.com/colombia/precios, alegra.com/colombia/facturacion-electronica, el documento soporte en la ayuda de Alegra, quadre.app, la guía de factura electrónica de Quadre.

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